区划沿革
1954年9月，从疏附、疏勒、英吉沙、蒲犁4县的柯尔克孜族聚居区划出 31个乡，从乌恰县的柯尔克孜族聚居区划出2个乡，成立阿克陶县（国务院1955年1月批准），划归克孜勒苏柯尔克孜自治区，阿合奇县由阿克苏专区划入克孜勒苏柯尔克孜自治州，乌恰县由喀什
行政区划入克孜勒苏柯尔克孜自治州。 [5]
1976年，新疆维吾尔自治区党委、革委会决定：将自治州所属阿克陶县划归喀什专区。原阿克陶县境内的奥依塔克公社和哈热开其克公社的居鲁克巴西大队划入州种羊场（县级建制）管理，仍隶属于自治州。同时，将喀什专区的伽师县及县境内的地方国营农场伽师总场（县级建制）划入克孜勒苏自治州。
1980年，自治区党委、人民政府决定：恢复阿克陶县和伽师县原来的行政归属，阿克陶县仍划归克孜勒苏自治州，奥依塔克公社和居鲁克巴西大队仍交阿克陶管理。同时，伽师县及境内的伽师总场仍划归喀什专区。
1984年4月，自治州红旗一场、二牧场划归新疆生产建设兵团农三师。
1986年6月，国务院批准撤销阿图什县，成立阿图什市。
区划详情
2017年，克孜勒苏柯尔克孜自治州辖阿图什市、阿克陶县、乌恰县、阿合奇县3县，下辖3个街道、39个乡镇（场）。自治州州府是阿图什市，政府驻阿图什市帕米尔路西3院。
| 地名 | 驻地 | 面积（平方千米） | 行政区划代码 | 区号 | 邮编 |
|---|
| 阿图什市 | 光明路街道 | 15698 | 653001 | 0908 | 845350 |
| 阿克陶县 | 阿克陶镇 | 24535 | 653022 | 0908 | 845550 |
| 阿合奇县 | 阿合奇镇 | 11545 | 653023 | 0997 | 843500 |
| 乌恰县 | 乌恰镇 | 19118 | 653024 | 0908 | 845450 |